原核生物转录组测序

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原核转录组测序是基于二代高通量测序平台，构建链特异性文库研究原核生物在某个时期或者在某种环境条件下转录出来的所有mRNA，从基因序列水平和表达水平来获得原核生物在某个时期或者在某种环境条件下所有的序列信息。由于原核生物mRNA没有polyA尾结构，需要去除rRNA来获得mRNA，安诺基因针对不同的研究物种采取Ribo-Zero试剂盒有效的去除rRNA，保证数据量，并构建链特异性文库来研究原核转录组的结构特征。
技术路线

产品参数

生物信息学分析内容

生物信息分析

(1)对原始数据迚行质控；

(2)测序评估（比对统计、测序随机性评估、Reads在基因组上的分布）；

(3)统计rRNA去除效率（rRNA比例统计）；

(4)基因表达水平分析；

(5)基因差异表达分析；

(6)差异基因的GO富集分析；

(7)差异基因的KEGG富集分析；

(8)蛋白互作网络分析；

(9)SNP和InDel分析；

(10)预测新转录本及功能注释；

(11)UTR注释及相兲分析；

(12)Promoter预测；

(13)反义转录本预测；

(14)ncRNA分析。
样品要求

(1)      样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA；

(2)      样品需求量：≥10 μg；

(3)      样品浓度：≥250 ng/μl；

(4)      样品纯度：OD260/280=1.8~2.2；OD260/230=1.8~2.2；

样品要求