一个小型研究表明,DNA测序结果显示在我们身体周围空气中存在个性化的微生物群落。

        人体皮肤微生物组越来越受到关注,但来自俄勒冈大学的一项最新研究显示,人体也被包围在自身的微生物“云”中,这一研究成果公布在9月22日的的PeerJ杂志上,指出通过鉴别个人周围的细菌组合,能识别出个体特征来。

        文章的第一作者和通讯作者是来自俄勒冈大学的James F. Meadow,他对于微生物组学十分感兴趣,这种有潜力像指纹一样独特地识别个体的生物特征,近年来受到了许多科学家们的关注,由此也发现这些微生物组与皮肤,肠道,多种疾病之间的密切关系。

        在这项研究中,研究人员做了两个实验。

        首先他们要求11位志愿者在一个经过消毒的房间里坐上四个小时,并用培养皿将他们层层包围,还悬置了空气净化器来捕捉悬浮的微生物。在实验结束后,他们对这些样品中的DNA进行测序,归类每个人的微生物群。

        同时研究人员也在另外一个设置相同但空无一人的房间进行了同样的实验,之后比对这两个实验所获得的数据,结果显示这两个空间里的微生物有明显区别。

        “我们以为只能鉴别出个体周围的人体微生物组,但是却惊讶的发现我们可以仅仅通过他们的微生物云,就能识别出大部分的人来,”Meadow说。

        也就是说对于75%的实验参与者来说,微生物云可以区分两个人。研究人员对微生物云的样本进行了测序,发现许多志愿者的微生物云带有相同的细菌,但细菌的浓度却各不同。

        “如何检测环境是一个家庭或者一家医院的话,这种个体差异估计检测不出来,因为太复杂了,”来自芝加哥大学的微生物生态学家Jack Gilbert (未参与该项研究)说,“因此这样严格受控的环境能帮助我们了解人体之间的这种细微差异。”

        目前研究人员还不能完全确定一个人的微生物云能覆盖多大的范围,但据估计,我们的微生物漂浮在半径90厘米的范围以内,这意味着在任何比较拥挤的空间里(地铁、杂货店,或你办公室),我们各自的微生物有很大可能混合在一起。研究人员推测,当微生物混合在一起时,人们或从对方那里收到细菌“纪念品”,这可能是我们发展出自己特有的微生物群的一个潜在来源。

        不过文章作者也指出,虽然无菌环境中可以用通过微生物来识别个体,但是依然可能存在污染的情况。

        “要将坐在办公室或者医院的个体信息翻译出来,还需要进一步的努力,”文章另外一位作者,俄勒冈大学Adam Altrichter说,“但希望随着技术的进步,我们能降低检测限制,在一个更加现实的环境中捕捉个人的微生物‘指纹’”。

        Meadow研究组在另外一项微生物实验中,发现手机能够提供机主的个人菌群信息,并有望成为新一代用于监测微生物与人体周边环境的传感器。

        他们募集了17名受试者,从受试者的惯用手食指和拇指上采集微生物,并与智能手机触摸屏上的微生物样本进行测序比对。研究发现,智能手机上的菌群与机主手指上的菌群高度相似,其中,手指上检出的常见细菌里,有82%同时出现在了手机上。

        这项成果同样发表在PeerJ杂志上。

        本文转自生物通:http://www.ebiotrade.com/newsf/2015-9/2015924160107218.htm

2015年09月28日

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